蜡样芽孢杆菌群的基因组学时代及以后的分类学

　　在微观世界中，有一细菌类群名为蜡样芽孢杆菌类群(Bacillus cereus group)的细菌，它们的存在对我们的食品安全和公共卫生至关重要。这些细菌能够在各种环境中生存，有的甚至能产生毒素，引发食物中毒。但它们的分类命名非常复杂，即使是相关领域的科研人员也在努力跟上这些细菌的分类和命名。

　　蜡样芽孢杆菌群是一个包含多个密切相关菌株的复杂群体。随着基因组学时代的到来，科学家们利用DNA序列的比较，对这些细菌进行了更精确的分类。这就像是用家谱来追溯人类的血缘关系一样，基因组学帮助我们理解了这些细菌之间的亲缘关系。

　　然而，这个过程并不简单。过去二十年中，随着研究的深入，蜡样芽孢杆菌群的分类发生了多次变化，这让非专业人士难以跟上。一些细菌原本被认为是蜡样芽孢杆菌，后来却被重新分类到其他种类。这就像是突然发现你的远亲其实是你的近邻一样令人惊讶。

　　科学家们提出了多种分类框架，包括基于表型(即细菌的外观和行为)、基因组(即细菌的DNA序列)以及两者结合的混合命名系统。每种方法都有其优点和缺点，但共同的目标是为了更好地理解这些细菌，以便在食品安全和疾病预防方面做出更明智的决策。

　　未来，随着科技的进步，我们可能会有更多的工具来解决这些分类上的难题。但即使是最先进的基因组学技术，也不能完全替代传统的微生物学研究。毕竟，了解一个细菌的DNA，不等于了解它的全部秘密。

　　图 截止2020年的B. cereus group分类时间表

　　蜡样芽孢杆菌的分类空间经历了许多变化，形成了一个模糊、不标准化和相互冲突的命名环境，阻碍了蜡样芽孢杆菌研究人员和利益相关者之间的交流。为了降低分类错误识别的风险，避免对分离物的潜在毒性进行潜在有害的错误分类，对蜡样芽孢杆菌分类学感兴趣的科学家和其他专业人员明确和透明地交流分类分配方法至关重要。在这里提供了在过去的25年中，蜡样芽孢杆菌发生的主要分类和命名变化的历史，以及由此产生的问题。对目前几种蜡样芽孢杆菌的分类框架进行了深入的描述，包括各自的优缺点。最后，提出了今后扩展蜡样芽孢杆菌分类框架的方向和考虑。因此，跟上蜡样芽孢杆菌的分类往往是具有挑战性的;然而，蜡样芽孢杆菌分类学领域存在的开放性问题和挑战，以及基因组学和微生物学方法的最新进展，表明蜡样芽孢杆菌的研究是一个令人兴奋和充满活力的时代。

　　参考文献：

　　Carroll L M, Cheng R A, Wiedmann M, et al. Keeping up with the Bacillus cereus group: taxonomy through the genomics era and beyond[J]. Critical reviews in food science and nutrition, 2022. 62(28): 7677-7702.