基于新型分子靶标构建实时定量PCR检测葡萄球菌方法

　　葡萄球菌为常见病原菌，广泛分布于自然界中。金黄色葡萄球菌是其中一种常见的重要的食源性致病菌，可产生肠毒素导致腹泻呕吐。与金黄色葡萄球菌不同，头状葡萄球菌、山羊葡萄球菌以及表皮葡萄球菌为凝固酶阴性菌(CoNS)。凝固酶阳性菌与凝固酶阴性菌曾被认为是共生体，但现研究表明，CoNS则被认为是机会致病菌。此外，CoNS常见于即食食品中，已然成为食品中常见的食源性致病菌。研究显示，在CoNS中，表皮葡萄球菌、头状葡萄球菌以及山羊葡萄球菌这三种葡萄球菌均与人类疾病相关，且其亲缘关系较近，难以区分。

　　Eiseul Kim等人开发一种快速、精确且高效的检测方法以检测食品中的以上四种葡萄球菌。基于泛基因组分析，筛选出4个新的分子靶标(金葡菌GntR家族转录调控相关基因、表皮葡萄球菌磷酸甘露糖变位酶相关基因、头状葡萄球菌FAD依赖性尿酸羟化酶相关基因以及山羊葡萄球菌革兰氏阳性信号肽蛋白相关基因)。引物特异性分子靶标对100株非目标参考菌株显示出高度特异性。四种葡萄球菌的纯培养物及其人工污染样品的最低检测限均为102cfu/mL。此外，实时PCR可成功从多种食品样品中检测到目标菌株的存在。因此，本研究方法可作为葡萄球菌属监测中的一种快速准确的检测手段，有助于控制食品中葡萄球菌污染。

　　Figure 1. Pan-genome analysis generated with Anvi’o software (version 7.0) for 155 staphylococci genomes. The layers represent individual staphylococci genomes organized by their phylogenomic relationship. In the layers, the dark and bright areas within the bars indicate the presence and absence of genes, respectively. The ANI values are represented by a heatmap determined at high (black) and low (gray) similarities.

　　文章来源：https:// doi.org/10.3390/foods10112839