食源性致病菌检测现代方法综述

导读：文章讨论了传统的培养方法与现代分子生物学技术的结合，特别是针对细菌、真菌和病毒的检测。文中介绍了多种检测方法，包括PCR、实时PCR、数字PCR、RT-PCR和二代测序技术（NGS）等，并探讨了这些方法在食品病原体检测中的应用和局限性。综述还强调了NGS在食品微生物学中的强大应用，尤其是在鉴定食源性病原体方面的潜力。

一、现代食源性病原体检测技术的概述

尽管食品保存技术的进步延长了食品的保质期，减少了变质和病原微生物的生长，但食源性疾病仍然是一个重要的公共卫生问题。传统的微生物培养方法虽然仍然是病原体检测的基础，但它们存在诸多局限性，如检测时间长、无法识别非培养微生物等。因此，研究者们开始将传统方法与现代分子检测技术相结合，以提高检测的速度和准确性。

PCR技术及其各种变体（如实时PCR和数字PCR）在食源性病原体的检测中扮演着重要角色。这些技术能够快速、准确地检测出极低浓度的病原体DNA。然而，这些方法也存在局限性，如需要精心设计的引物，且易受抑制剂的影响。RT-PCR技术则被用于检测病毒RNA，尽管它也有其局限性，如成本较高和需要专业人员操作。

用于检测和识别食源性病原体的下一代测序方法^[1]

二、二代测序技术在食源性病原体检测中的应用

二代测序（NGS）技术作为一种革命性的工具，正在改变我们对食源性病原体的检测和理解。NGS能够对食品样本中的微生物进行高通量测序，从而鉴定出多种病原体，包括细菌、真菌和病毒。这种技术不仅能够提供关于病原体的遗传信息，还能够用于追踪疾病的传播和起源。

NGS在检测食源性细菌病原体方面显示出巨大的潜力，能够直接从食品样本中鉴定出多种病原体，如沙门氏菌和李斯特菌。对于病毒病原体的检测，NGS通常与其他方法结合使用，如RT-PCR，以确认阳性样本并进行进一步的序列分析。

综述还指出，尽管NGS技术在食源性病原体检测中具有显著优势，但其应用仍面临一些挑战，如数据分析的复杂性、成本和专业知识的限制。因此，研究人员和食品安全专家需要不断努力，以优化NGS的应用，并将其与其他检测方法相结合，以确保食品的安全和公共健康。

参考文献：

[1] Aladhadh M. A review of modern methods for the detection of foodborne pathogens[J]. Microorganisms, 2023, 11(5): 1111.