季节性流感的全球传播和进化
季节性流感的全球传播和进化
东亚、南亚和东南亚(以下简称东南亚)被认为是全球季节性流感循环的关键区域。然而,东南亚地区的季节性流感迁移网络仍然不清楚,包括大流行相关干扰如何改变这一网络。复旦大学余宏杰课题组在国际学术期刊《Nature Communications》发表的“Disruption of seasonal influenza circulation and evolution during the 2009 H1N1 and COVID-19 pandemics in Southeastern Asia”利用 2007-2023 年间流感病毒 A/H3N2 和 B/Victoria 的遗传、流行病学和航空旅行数据,表征了这些病毒从东南亚地区内外的传播模式。
流感 A/H3N2 和 B/Victoria 亚型在大流行季节的活动中断
分析两种季节性流感病毒从东南亚区域至温带地区的传播规律后发现,2009年甲型H1N1流感大流行仅扰乱了A/H3N2从东南亚区域至温带地区的秋冬季传播,没有扰乱B/Victoria;COVID-19大流行对二种季节性流感均有扰乱。
图1 东南亚和北半球温带地区以及南半球温带地区季节性流感病毒的检测强度、阳性率和 HA 基因序列数量的变化情况[1]
东南亚持续流行的流感谱系
研究发现,东南亚循环的A/H3N2亚型被划分为持久性谱系的比例(86.1%)显著高于B/Victoria(36.3%)(P<0.001),且A/H3N2持久性谱系的比例在COVID-19大流行所在的流感季中有所升高。
图2 东南亚地区持久谱系及其在均匀子采样方案下的拓扑和时间分布[1]
东南亚地区 A/H3N2 移动网络特征化
基于东南亚内部识别的A/H3N2持久性谱系,研究团队在东南亚内部的22个地理区域尺度上开展贝叶斯系统进化地理学分析,发现相较于大流行间期,2009年甲型H1N1流感大流行和COVID-19大流行时期东南区区域内部传播强度分别下降了52.2%和85.3%。此外,COVID-19大流行流感季的内部传播模式也出现了更加明显的分化差异。
图3 东南亚地区持续性 H3N2 亚型流感病毒的迁移网络和系统发生相似性[1]
结论
结果表明两次大流行事件对东南亚区域季节性流感传播和进化的影响不同,且背后的机制也可能存在差异。对于认识东南亚区域季节性流感的传播和进化提供了定量证据,且揭示了东南亚内部的季节性流感传播网络和特征,并验证了季节性流感对不同大流行事件的差异化反应。
参考文献:
[1] Chen Z, Tsui JL, Cai J, et al. Disruption of seasonal influenza circulation and evolution during the 2009 H1N1 and COVID-19 pandemics in Southeastern Asia. Nat Commun. 2025;16(1):475.
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