贝类监测能更好地反映水体的污染
监测大陆和海洋水体中的致病性肠道病毒对于控制人类的病毒污染至关重要。人类诺如病毒(NoV)是存在于地表水和食品中的主要肠道病毒。在全球变化的背景下,改善水生环境中病毒污染的管理,从而限制脆弱水体或食品的污染。为了评估与直接水分析相比,特定积累系统在提高水体中NoV检测方面的潜力。被动采样器(Zetapor filters)和三种双壳类软体动物贝类(bivalve molluscan shellfish,BMS)(Dreissena polymorpha、Mytilus edulis 和 Crassostreas gigas)用作积累系统,以确定它们在监测大陆和海洋水体病毒方面的潜在能力。
在经常受粪便污染影响的特定区域(大陆和沿海水域)进行了为期一年的监测,共12次直接水取样、被动采样器(Passive samplers,PS)积累和BMS暴露污染。使用合适的方法,在这些积累系统和水中同时检测NoV和FRNAPH(感染性和基因组),以确定检出率和污染情况。
1.三种方法的病毒的提取率均远高于1%
D. polymorpha 和地表水的平均提取率为13%和26%(图1)。这些值显著低于其他基质(PS、C. gigas 和 M. edulis),其中提取率均高于49%。总体而言,用于检测每种基质中病毒基因组的方法非常合适,因为提取率远高于1%,符合 NF EN ISO 15216-1(2017)标准的建议。
图 1使用两种病毒过程对照材料测定所有收集样品中每种基质的病毒提取率。源自参考文献
2.BMS中NoV和FRNAPH(感染性和基因组)的检出率远高于PS和水样
从图2在各种基质中观察到 NoV 和 FRNAPH(感染性和基因组)的检出率存在显著差异。D. polymorpha 的检出频率最高,平均为 25.2%,而 PS 和 C. gigas 平均为 8%和 7.5% (p 值<0.01)。水和M.edulis中的检测频率没有显著差异,平均为 8.5%和 21.7%。同时为了确定五个病毒靶标的相关性,通过所有采样点来查看每个样本的检出率。在所有样品中,感染性FRNAPH检出率最高,在BMS中检测到的感染性 FRNAPH 甚至高于水样和PS。而在FRNAPH-I和NoV基因组的检测频率方面,基质间没有发现显著差异。
图 2 不同基质中 NoV 和 FRNAPH 基因组的检测频率以及总感染性 FRNAPH。源自参考文献
3.BMS中NoVII和FRNAPHII强烈的的依赖关系
为了确认BMS在水体评估病毒污染方面的效用,对所有三个物种进行了主成分分析(PCA),以显示五个靶标的存在之间的关系(图3)。沿 F1 和 F2 轴的表示描述了总信息的81%。5个参数中有3个接近相关圈,表明感染性FRNAPH的存在、FRNAPH-II基因组和NoV GII基因组之间存在联系。相反,代表NoV GI基因组和FRNAPH-I基因组的箭头与其他参数相距甚远,表明与其他三个靶标没有关系。卡方分析显示在 BMS 中观察到 NoV GII 基因组和 FRNAPH-II 基因组之间存在强烈而显著的依赖性(p 值 = 5.416 × 10−9),FRNAPH-II 基因组与感染性 FRNAPH 之间也存在显著相关性(p值 = 3.883 × 10−4)。
图 3针对双壳类软体动物贝类的病毒参数的主成分分析。源自参考文献
参考文献:Toward better monitoring of human noroviruses and F-specific RNA bacteriophages in aquatic environments using bivalve mollusks and passive samplers: A case study
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