《Cell》通过934个古基因组，精准追溯HIV抗性基因CCR5-Δ32的起源与扩散史

或许此前被认为在人类中曾受到自然选择影响的免疫相关位点中，有一个最为备受争议的便是一个 32 个碱基对的缺失（CCR5delta32，rs333），它会在 C-C 趋化因子受体 5 基因（CCR5）中引入一个提前终止密码子。CCR5 是 G 蛋白偶联受体家族中的一员，在由 C-C 趋化因子（CCL3、CCL4 和 CCL5）激活后，它在调节炎症反应方面发挥着关键作用，能够促进免疫细胞与环境之间的信息交流。因此，CCR5 可以作为宿主免疫反应的调节因子。

1996 年，CCR5 被确认为巨噬细胞嗜性 HIV 病毒株所必需的共受体，随后有报道称，携带这种等位基因纯合形式的个体可以通过 CCR5delta32 阻止 HIV-1 的感染。CCR5 现在是预防和治疗 HIV 感染的重要靶点（7位被宣布“治愈”的艾滋病患者：艾滋病治愈不仅仅与CCR5有关），可通过多种治疗策略来实现。例如，最近有一位感染了 HIV-1 的女性患者通过 CCR5delta32/delta32 单倍体脐带血移植，成功治愈了 HIV-1 病症以及急性髓系白血病。这种方法已成功治愈了另外两例采用相同基因改造的无关供体干细胞治疗的类似病例。趋化因子受体变异体 CCR5delta32 与 HIV-1 抗性及其他病症有关。其在欧洲人群中的进化历程和等位基因频率（10%-16%）一直备受争议。

2025年7月10日，丹麦哥本哈根大学Simon Rasmussen团队在Cell 在线发表题为“Tracing the evolutionary history of the CCR5delta32 deletion via ancient and modern genomes”的研究论文，该研究详细阐述了该缺失体在时间和空间上的进化历程。

文章模式图（图源自Cell ）

该研究发现 CCR5delta32 等位基因是在一个由 84 种变异组成的已有单倍型上产生的。利用这些信息，该研究开发了一个单倍型感知的概率模型，用于筛选 934 个低覆盖度的古代基因组，并追溯 CCR5delta32 缺失的起源至距今约 6700 年（BP）的西欧草原地区。

该研究提供了西欧地区在距今 8000 至 2000 年 BP 期间对 CCR5delta32 单倍型进行正向选择的有力证据，并表明在拉丁美洲存在该单倍型的原因可以归因于哥伦布大发现后的基因交流。最后，该研究指出 CCR5delta32 基因型 - 单倍型 - 表型之间的复杂关系，这在针对 CCR5 受体的治疗策略中需要加以考虑。

参考消息：https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(25)00417-9