阿奇霉素经验性治疗扰动COVID-19患者上呼吸道微生物组与耐药组，但无抗炎益处

阿奇霉素是一种广泛使用的抗生素，在新冠疫情（COVID-19）期间常被用于治疗住院患者。然而，对于病毒性呼吸道感染患者，经验性使用阿奇霉素对呼吸道微生物组的影响尚不明确。近日，Charles R. Langelier团队在nature microbiology上发表了题目为Empiric azithromycin alters the upper respiratory microbiome and resistome without anti-inflammatory benefit in COVID-19的研究成果。本研究基于一项前瞻性多中心队列，对1,164名因新冠肺炎住院患者的鼻拭子样本进行了纵向宏转录组学分析，比较了接受阿奇霉素治疗（n=366）、未使用任何抗生素（n=474）以及接受其他抗生素治疗（n=324）三组患者的上呼吸道微生物组、耐药组及全身免疫反应。研究发现，阿奇霉素改变了微生物组的组成，同时提高了大环内酯/林可酰胺/链阳菌素（MLS）类耐药基因的表达水平及其相对占比。这些变化在用药后1天内即出现，并持续超过一周。MLS耐药基因的表达与共生菌及潜在致病菌相关，而患者血液及气道中的宿主炎症相关基因表达未见差异。研究结果表明，经验性使用阿奇霉素治疗会对上呼吸道微生物组和耐药组产生显著影响，但并未表现出明确的抗炎益处。

图1 研究概览与受试人群基线特征

图2 阿奇霉素治疗改变呼吸道微生物组

图3 阿奇霉素暴露改变呼吸道耐药基因组

图4 气道耐药组与微生物组内部的相关性

文章链接：https://www.nature.com/articles/s41564-026-02285-8