婴儿配方奶粉中克罗诺杆菌的基因型分析
阪崎克罗诺杆菌是一种机会性病原体,可引起新生儿危及生命的感染。苏黎世大学的Marc J.A. Stevens等研究人员对15年内从婴儿配方奶粉(PIF)植物中分离的阪崎肠杆菌菌株(N=26)进行测序。17株菌株属于ST83序列型,9株属于ST4序列型。核心基因组MLST揭示了大多数ST83和一些ST4菌株的克隆性,表明这些菌株来源于持久种群。ST83和ST4菌株之间的基因组比较确定了群体特异性基因,其中一些基因可能与持久性有关,例如ST83中的聚集和抗应激基因以及ST4菌株中的菌毛基因。
单核苷酸多态性比较显示乳糖操纵子中有20个SNPs。这种乳糖操纵子被证明是转座子相关的,并存在于所有PIF分离株中,但仅存在于449个公开可用的阪崎肠杆菌基因组中的171个,这表明乳糖在PIF环境中作为进化力的作用。
在ST83和ST4菌株集中分别发现了18个和20个抗微生物耐药性基因。4株ST4菌株具有通过HGT获得的mcr6.1基因,编码粘菌素抗性。

本研究表明,不断进化的阪崎肠杆菌种群在工业环境中同时存在,这对公众健康有潜在影响。
参考文献:
Marc J.A. Stevens, Nicole Cernela, Roger Stephan, Angelika Lehner. Comparative genomics of Cronobactersakazakii strains from a powdered infant formula plant reveals evolving populations. LWT - Food Science and Technology.2023.184: 115034.
Doi: 10.1016/j.lwt.2023.115034
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