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转录组学、表观基因组学和空间代谢组学细胞分析重新定义了区域人类肾脏解剖结构

原创

来源：牛沁雅

2024-05-13 09:46:16

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核心提示：人类肾脏的转录、表观遗传和代谢组学景观尚未在所有解剖区域进行研究，这限制了我们对细胞类型特异性功能的理解以及新治疗靶点的潜在识别。

作者采用同步高通量单细胞 ATAC/RNA 测序 (SHARE-seq) 和空间分辨代谢组学来分析来自不同肾脏解剖区域的54个人类样本。生成了446267个细胞的转录组和401875个细胞的染色质可及性概况，并开发了一个软件包来分析408218个空间解析的代谢组。结果发现，相同的细胞类型包括髓袢升支细段、粗段和主细胞，根据解剖位置显示出不同的转录组、染色质可及性和代谢组特征。调查代谢相关基因谱揭示了肾单位片段之间不重叠的代谢特征以及患病近端小管（PT）细胞中脂质代谢失调。将多模式组学与临床数据相结合，确定PLEKHA1作为一种疾病标志物，其体外敲除增加了PT分化中的基因表达，表明可能的致病作用。这项研究强调了先前未得到充分体现的人类肾脏解剖结构的细胞异质性。