联合检测方法鉴定吸入性肺炎患者的微生物学特征

吸入性肺炎（AP）对全球公共卫生构成挑战。本研究的主要目的是确定通过联合检测方法评估的AP 患者的微生物特征，包括常规微生物检测（CMT）、复杂感染检测芯片（CCID）和宏基因组下一代测序（mNGS）。通过结合CMTs、CCID和mNGS技术，这项多中心前瞻性研究阐明了AP和AspRF-CAP患者的微生物学特征。纹状棒状杆菌、铜绿假单胞菌、肺炎克雷伯菌和白色念珠菌是我国最常见的AP病原菌，而白色念珠菌、铜绿假单胞菌和肺炎克雷伯菌是最常见的AspRF-CAP分离微生物。在分子技术新兴的新时代，早期联合检测提高了病原体的鉴定率，并可能促进抗生素的早期降解，从而避免不必要的广谱抗生素和有害后果。此外，mNGS的应用可能有助于早期识别不常见的病原体。

误吸被定义为将口咽或胃内容物吸入喉部和下呼吸道。吸入性肺炎（AP）是指由于吸入由病原菌定植的口咽或胃肠道分泌物进入下呼吸道而引起的肺泡和全身炎症的过程。多种危险因素，如吞咽障碍、咳嗽反射受损、意识障碍、退行性神经系统疾病、痴呆、卒中和肠内管饲，都与 AP 有关。AP的发病率随着年龄的增长而迅速增加。据报道，AP 患者的发病率和死亡率高于非吸入性社区获得性肺炎（CAP）患者。随着人口老龄化和 AP 患病率的增加，可以预见到巨大的医疗保健和经济负担。

然而，在AP 中预防性使用抗生素并不能提供临床益处，并且可能会引起耐药性，导致AP患者需要加强抗生素治疗。此外，经验性抗菌治疗不足可能导致死亡率显著增加。因此，早期识别和表征AP病原体对于进行适当的抗菌治疗和改善临床结果至关重要。越来越多的证据表明，厌氧菌在AP中的重要性正在减弱，大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、肺炎克雷伯菌和铜绿假单胞菌成为常见的致病微生物。此外，另一项研究报告称，肺炎链球菌是AspRF（AspRF-CAP）CAP 患者的主要病原体。AP和AspRF-CAP病原体的检测存在许多困难。首先，AP和AspRF-CAP致病病原体的分离率和鉴定率通常较低，由于经验性治疗和抗菌药物的应用，敏感性差且耗时。其次，多种微生物感染在重症肺炎中很常见，而常规微生物培养不容易同时检测。此外，临床微生物学实验室中使用的常规微生物测试（CMT）具有一定的局限性。该技术耗时且病原体检测范围有限，因此不适合识别未知或难以培养的病原体。分子诊断技术的进步提高了识别和表征现有和以前未识别的 AP 和 AspRF-CAP 病原体作用的潜力。复杂感染检测芯片（CCID）是一种快速检测病原微生物的新技术。我们之前的多中心前瞻性观察研究表明，CCID在老年肺炎患者中很有前途，因为它具有快速准确地检测多种病原微生物的潜力，并且受先前抗菌治疗的影响较小。此外，宏基因组二代测序（mNGS）作为一种无假设、无偏倚且不依赖培养的模式，已逐步应用于呼吸道感染的病因学诊断。鉴于AP和AspRF-CAP病因的复杂性以及病原体检测技术不尽如人意，需要具有高灵敏度和准确性的多重检测技术。

建立AP和AspRF-CAP的病因学诊断可实现个体化治疗，例如适当选择抗生素、减轻广谱抗生素滥用、促进有效的抗菌药物管理，并最终改善患者康复。分子病原体检测技术的灵敏度、可负担性和可用性的提高显著提高了对AP和 AspRF-CAP病因学的理解。然而，目前尚缺乏对中国AP和AspRF-CAP病因的研究。因此，本前瞻性研究的主要目的是描述成AP和AspRF-CAP患者的微生物学特征和临床特征，并评估联合检测对中国AP和AspRF-CAP病因学诊断的益处。

从2021年6月到2022年3月，共纳入来自3家医院的39例AP或社区获得性肺炎伴吸入危险因素（AspRF-CAP）患者。收集呼吸道标本，包括支气管肺泡灌洗液（BALF）、痰液和气管抽吸物，用于微生物检测。结果表明，AP患者年龄较大，发病至入院时间较短，糖尿病、慢性心脏病、脑血管疾病等不同基础疾病患病率较高，CURB-65评分较高（均P<0.05）。在AP和AspRF-CAP患者中分别检测到213株和31株微生物。AP中最常见的病原体为纹状棒状杆菌（17/213,7.98%）、铜绿假单胞菌（15/213,7.04%）、肺炎克雷伯菌（15/213,7.04%）和白色念珠菌（14/213,6.57%）。此外，AspRF-CAP最常见的病原体是白色念珠菌（5/31,16.13%）、铜绿假单胞菌（3/31,9.68%）和肺炎克雷伯菌（3/31,9.68%）。9例非存活AP患者中最常见的病原体为肺炎克雷伯菌（7/67,10.45%）和光滑念珠菌（5/67,7.46%）。AP患者的早期联合检测方法可提高病原体的阳性检出率，并可能加快适当的抗生素治疗策略的启动。

参考文献： DOI https://doi.org/10.2147/IDR.S461935