激光微孔分选技术突破——单细胞微生物检测迈入高效精准时代

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来源:李康倩
2025-02-28 08:14:44
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核心提示:中国科学院长春光学精密机械与物理研究所联合多个团队,开发出功能化微孔激光分选系统(FMLS),实现单细胞微生物的高效捕获、低损伤分选及多模态检测,相关成果发表于《Sensors and Actuators: B. Chemical》期刊。

一、 技术突破:微孔芯片与激光分选的完美结合

1. 微孔芯片(M-chip)的设计与制造:FMLS的核心创新在于微孔喷射芯片(M-chip),其通过精密光刻与化学气相沉积技术,在硅基板上构建数百万个六边形微孔阵列(孔径8-15μm)。微孔表面经等离子体处理,形成超亲水-超疏水界面,将微生物悬浮液分散为飞升级液滴阵列(每个液滴仅容纳1个细胞)(图1)。这种设计解决了传统液体分选中细胞迁移聚集的难题,显著提升单细胞捕获效率。

 

图 1.M 芯片的精确制造、预处理和表征。(a) 通过光刻胶光刻技术制备硅母版。(b) 聚对二甲苯 C 在硅母体上的化学气相沉积 (CVD)。(c) 冗余聚对二甲苯的反应离子刻蚀 (RIE) C. (d) 通过 HNA 刻蚀释放微孔膜。(e) 疏水性微井膜的采集。(f) 玻璃基板上的金属蒸发。(g) 金属表面和微孔表面的等离子体处理。(h) M 芯片的组装。(i) 接触角为 CA= 62.74 的未处理金属层表面上的水滴照片。(j) 等离子体处理的金属层表面上的水滴照片,显示接触角为 CA= 8.37 的超亲水表面。(k) 未经处理的聚对二甲苯薄膜表面的水滴照片,显示接触角为 CA= 113.11 的疏水表面。(l) 等离子体处理的聚对二甲苯薄膜表面上的水滴照片,显示接触角为 CA= 7.68 的超亲水表面。(m) 处理过的 M 芯片表面没有液体层的水滴照片。

 2. 激光诱导前向转移(LIFT)技术优化:传统LIFT技术需克服液体表面张力,导致高能量激光损伤细胞。FMLS系统通过微孔固定液滴,仅需120nJ低能量激光即可精准分选单细胞(图2),比传统LIFT所需能量(11μJ)降低两个数量级,细胞存活率从不足50%提升至95%以上(图3)。

 

图2.通过调整激光能量评估各种微生物细胞系的单个微生物细胞分选效率。比例尺表示10μm

 

图 3.细胞活力分析和单细胞 PCR。(a) 单细胞分选后孵育 36 小时的大肠杆菌和酿酒酵母细胞的照片。(b) 孵育 36 小时后分选的单细胞存活率。(c) 对照大肠杆菌细胞悬液 (CD) 和大肠杆菌单细胞集落 (D1-D8) 的凝胶电泳照片。M,DNA 分子量标准。(d) 来自对照酿酒酵母细胞悬液 (CY) 和酿酒酵母单细胞集落 (Y1–Y8) 的凝胶电泳照片。M,DNA 分子量标准

 3. 多模态检测集成:系统整合明场、荧光与拉曼光谱检测(图4),例如通过拉曼信号区分产类胡萝卜素的酵母菌与非产菌株,实现特异性分选。这种多维度检测为微生物功能研究(如光合作用、耐药性)提供了新工具。

二、关键实验结果:高效、精准、低损伤

1. 单细胞捕获效率超80%

针对大肠杆菌、酿酒酵母、蓝藻等不同尺寸微生物(1-10μm),FMLS在最佳浓度(5×10⁷ cells/mL)下捕获效率达80%-90%。即使面对易聚集的藻类(如衣藻),仍保持82%效率,远超微流控技术。

 2. 分选效率与存活率双高

· 分选精度:相邻微孔分选互不干扰,效率近100%。

· 存活率:分选后的大肠杆菌与酿酒酵母培养36小时存活率分别达97.2%与95.8%

· 基因组完整性:单细胞基因组覆盖率达88%,远超传统LIFT的38%,为基因测序提供高质量样本。

3.高通量潜力

单次样本处理可捕获20万个单细胞,通量约1000细胞/小时,未来通过微流控持续供样可进一步提升效率。

 三、技术优势:为何是颠覆性进步?

1. “微孔+激光”协同创新:M-chip解决液体分选中细胞迁移难题,激光能量需求降低99%,兼顾效率与细胞活性。

2. 多模态检测灵活性:支持明场、荧光标记及无标记拉曼检测,适应不同研究场景。

3. 广泛适用性:兼容1-100μm尺寸的微生物,包括难培养菌种,拓展了微生物多样性研究的边界。

4. 自动化与低成本:全自动分选减少人工干预,设备成本低于流式细胞仪,适合工业与实验室应用。

四、应用前景:从基础研究到产业落地

1.微生物资源开发

· 生物能源:分选高效产油藻类或产氢细菌,优化生物燃料生产。

· 药物筛选:从复杂环境样本中分离稀有微生物,挖掘新型抗生素。

2. 医疗诊断

· 肿瘤微环境研究:分析肿瘤相关微生物的单细胞功能,揭示其与免疫治疗的关联。

· 耐药性监测:通过拉曼光谱快速识别耐药菌,指导精准用药。

3. 环境科学

· 海洋与土壤微生物组:解析未培养微生物的功能,推动碳循环与污染修复研究。

· 病原体检测:从水样中高效分选致病菌,提升公共卫生监测效率。

五、挑战与未来方向

1. 通量提升:当前分选速度仍落后于流式细胞术,需优化微孔阵列设计与激光扫描速度。

2. 复杂样本适应性:针对粘稠或高杂质样本(如血液、污泥),需进一步验证系统稳定性。

3. AI集成:结合深度学习算法,实现实时细胞识别与分选决策,推动智能化升级。

六、结语:单细胞时代的“微生物手术刀”

FMLS系统通过微孔芯片与低能激光的巧妙结合,为单细胞微生物研究提供了高效、精准、低损伤的全新工具。其技术突破不仅解决了传统分选方法的痛点,更在基因组学、代谢组学及合成生物学等领域开辟了新可能。随着技术优化与多学科交叉,FMLS有望成为微生物研究的标准平台,加速从实验室发现到产业应用的转化,为人类健康与可持续发展注入新动能。

参考文献

原文链接:https://doi.org/10.1016/j.snb.2024.137202

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