创新多重qPCR技术:快速检测蓝藻毒素,守护饮用水安全

原创
来源:杨融
2025-05-16 11:58:59
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核心提示:随着全球有害藻类爆发(HABs)现象的加剧,尤其是蓝藻水华(cyanoHABs)对饮用水源和娱乐用水质量构成的威胁日益严重,快速、可靠的监测手段变得至关重要。本文将介绍一种创新的多重定量聚合酶链式反应(multiplex qPCR)方法,该方法能够迅速检测产生微囊藻毒素的基因,为保障公众健康提供新的工具。

研究背景:

近年来,全球蓝藻水华(cyanoHABs)引发的生态与健康风险持续加剧。微囊藻毒素(MCs)作为蓝藻产生的强效肝毒素,因其热稳定性和水溶性,极易通过饮用水和娱乐用水威胁人类健康。传统检测方法如ELISALC-MS/MS虽能定量毒素,但存在成本高、耗时长(通常需24-48小时)且无法区分产毒与非产毒菌株的局限性。随着分子生物学技术的发展,基于基因检测的定量PCRqPCR)逐渐成为研究热点,其通过靶向微囊藻毒素合成基因(如mcyE)实现产毒菌株的特异性识别。然而,现有方法多局限于单一基因检测,且DNA提取流程复杂,难以满足实时监测需求。本研究通过整合多重qPCR与快速DNA提取技术,首次实现了产毒基因的高通量、低成本快速筛查,为蓝藻毒素的早期预警提供了创新解决方案。

技术路线:

为了提高监测效率,研究人员开发了一种创新的多重定量聚合酶链式反应(multiplex qPCR)方法,用于快速检测产生微囊藻毒素的基因。该方法采用了两种不同的DNA提取方法:RapidDNAClassicDNA

具体步骤如下:

1、样本采集:从九个水库中采集水样,包括表面样品、综合样品、近取水口样品和取水口样品,确保样本的代表性和全面性。

2、DNA提取:

RapidDNA:通过高速离心和珠磨法(bead beating)提取DNA,无需传统净化步骤,简化了操作流程。

ClassicDNA:采用经典的过滤、沉淀、洗涤和纯化步骤,确保DNA的高纯度和完整性。

3、多重qPCR分析:

针对微囊藻毒素合成基因(如mcyE)以及其他常见毒素基因(如anaCsxtAcyrA),设计特异性引物和探针,进行多重qPCR反应,实现同时检测和量化多个目标基因。

1 RapidDNAClassicDNA方法的工作流程对比

4、结果验证:结合显微镜细胞计数、ELISALC-MS/MS等传统方法,验证qPCR结果的准确性和可靠性。

2 通过 RapidDNA(红色)和 ClassicDNA(蓝色)qPCR 方法检测到的四个水库中 mcyE 基因浓度的时间动态:犹他湖(a)、迪尔克里克水库(b)、回声水库(c)和斯科菲尔德水库(d)。同一天的多个圆圈代表同时收集的各种类型(表面、复合、近进水口、进水口样本)。灰色虚线表示使用 LC-MS/MS 观察到蓝藻水华(cyanoHAB)且检测到的微囊藻毒素(MC)高于或等于 0.3 µg/L 的第一个日期。堆积柱状图显示了 RapidDNAe)和 ClassicDNAfqPCR 方法的真阳性、假阴性、真阴性和假阳性病例的百分比。

构建高效、灵敏且实用的检测体系:

快速高效:RapidDNA方法省去了复杂的DNA纯化步骤,显著缩短了检测时间,适合资源有限的现场监测。

高灵敏度:ClassicDNA方法在低细胞密度条件下仍能有效检测目标基因,适用于早期预警。

多重检测:通过设计特异性引物和探针,实现了对多种毒素基因的同时检测,提高了检测效率和覆盖面。

数据关联性强:通过线性回归和ATS/Tobit回归模型,建立了基因浓度与毒素水平之间的定量关系,为预测和管理提供了科学依据。

结论:

创新的多重qPCR方法结合RapidDNAClassicDNA提取技术,为蓝藻水华及其毒素的监测提供了快速、可靠且经济高效的解决方案。这种方法不仅能够及时预警潜在的健康风险,还能为水资源管理和环境保护提供有力支持。未来,随着更多地区的应用和优化,这一技术有望在全球范围内推广,为保障公众健康和生态安全做出更大贡献。

文章来源:

https://doi.org/10.1016/j.watres.2025.123322

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