支持机器学习的SERS传感器:食源性病原菌脂多糖的多重检测
1.引言
脂多糖(LPS)是革兰氏阴性细菌外膜的重要成分,作为病原菌的关键生物标志物,其快速检测对食品安全和公共卫生至关重要。据世界卫生组织统计,全球每年约有6亿例食源性疾病,其中42万人因细菌感染死亡。传统检测方法如鲎试剂试验(LAL)和兔热原试验(RPT)存在耗时长、成本高等问题。表面增强拉曼散射(SERS)技术因高灵敏度和分子特异性,成为潜在替代方案,但需结合亲和探针富集目标分子以提高检测效果。本研究开发了一种基于线性聚合物聚甲基丙烯酸羟乙酯(pHEMA)的SERS传感器,通过氢键作用结合LPS,并利用机器学习分析光谱数据,实现对多种致病菌LPS的快速、低成本、多重检测。
本研究开发了一种基于线性聚合物聚甲基丙烯酸羟乙酯(pHEMA)的表面增强拉曼散射(SERS)传感器技术,通过pHEMA与LPS的氢键特异性结合及机器学习辅助光谱分析的方法,解决了传统LPS检测技术(如LAL法)耗时长、成本高的问题。具体试验方法为:首先采用纳米球刻蚀技术制备金膜覆纳米球(FON)等离子体基底,通过调控金膜厚度(150 nm)优化局域表面等离子体共振效应;其次合成具有65个重复单元的pHEMA作为广谱亲和探针,利用其羟基与LPS多糖结构域的氢键作用实现目标富集;将pHEMA与LPS预孵育后滴加于FON基底,经室温固化后,采用785 nm激光拉曼系统(功率38 mW,积分时间15 s)采集光谱数据;最后结合主成分分析(PCA)和支持向量机(SVC)等机器学习算法,对特征峰(如999 cm⁻¹的多糖振动峰)进行模式识别,实现对沙门氏菌、大肠杆菌等LPS的多重定量检测。
2.结果与讨论
SERS传感器构建流程:通过预复合pHEMA65与LPS形成氢键结合物,将其固定于FON基底表面,利用金纳米球的局域表面等离子体共振效应增强拉曼信号,优化孵育时间(2 h)与激光参数(785 nm,38 mW),实现LPS分子振动指纹图谱的高灵敏采集。
图 1 微生物电化学晶体管(MECT)的原理。 a) 微流控MECT装置,栅极(G)位于源极(S)和漏极(D)上方,电解质在微流控芯片中。b) MECT的电极结构。c) MECT的工作原理。d) 本研究与OECT的掺杂机制比较。
pHEMA对LPS检测的差异化贡献:对比LPS单独检测与pHEMA-LPS复合检测的PCA得分图,证实pHEMA通过氢键作用富集LPS分子(如Salmonella LPS的脂多糖O-抗原),显著提升不同菌株LPS的光谱分离度(PC1方差贡献率67.3%),解决无亲和探针时的光谱重叠问题。
图 2 SERS光谱比较(A)仅添加到FONs的LPS分析物和(B)LPS/pHEMA65复杂化后加入FONs。(C)基于仅LPS(左侧)与pHEMA的主成分分析(PCA)谱谱比较65/LPS(右图)显示了将LPS与pHEMA复合65促进LPS分析物的分化。每个数据点代表一个复制光谱,条件由数据点颜色表示。
LPS特征峰归属与分类效能:在500 μg/mL浓度下,pHEMA-LPS复合物于999 cm⁻¹(多糖C-O伸缩振动)、1032 cm⁻¹(C-C骨架振动)等位置呈现菌株特异性峰强比,结合PCA模型(PC1/PC2累计方差95%),实现沙门氏菌、大肠杆菌O26/O111的完全分类(无重叠簇)。
图 3 (A)pHEMA的平均SERS光谱65以及 pHEMA65三种LPS分析物的/LPS配合物。每个谱是FON基底上随机选定的5个点的3次解析复制的平均值。激光功率为38毫瓦,积分时间为15秒。(B)主成分1(PC1)与pHEMA中LPS最高浓度(500 μg/mL)的PCA评分图与PC265基于收集的SERS光谱的/LPS复形。
浓度梯度光谱响应规律:pHEMA-LPS复合物的拉曼峰强(如Salmonella LPS的999 cm⁻¹)随浓度对数呈线性增强(R²>0.98),检出限达0.7–1.5 μg/mL(低于食源性毒性阈值275 μg/mL),且特征峰位移<2 cm⁻¹,证实检测体系在宽浓度范围(4–500 μg/mL)的稳定性。
图 4 pHEMA的光谱65不同LPS浓度下的/LPS配合物。(A)血红细胞的SERS谱65/沙门氏菌LPS,(B)血性物质65/ECO26:B6LPS,以及(C)pHEMA65/ECO111:B4LPS。灰色高亮框代表用于构建各对应校准曲线的峰值。每个光谱均为在指定条件下记录的15个光谱的平均值。激光功率为38毫瓦,积分时间为15秒。
定量校准曲线与毒性阈值区分:以999/458 cm⁻¹(Salmonella)、999/1195 cm⁻¹(O26)和993/1282 cm⁻¹(O111)为响应参数,建立线性校准方程(R²=0.92–0.97),结合方差分析(p<0.05)显著区分毒性浓度(275 μg/mL)与安全浓度(如16 μg/mL),实现风险等级的快速判别。
图 5 校准曲线利用图4中对LPS浓度响应最佳线性响应的振动带构建,并相对于聚合物的碳酸三酯带进行了归一化(0 μg/mL光谱)。(A)pHEMA 的校准曲线65/沙门氏菌LPS,(B)血性物质65/ECO26:B6LPS,以及(C)pHEMA65/ECO111:B4LPS。绿色竖条虚线表示已知对人体有毒的LPS浓度(275 μg/mL)。(33,34)误差条表示均值的标准误,星号(*)表示统计显著差异(p < 0.05)。
复杂基质干扰与稀释策略:在10倍稀释苹果汁中,pHEMA-LPS特征峰(如734 cm⁻¹的果糖干扰峰)保持可辨识性,而5倍稀释时果糖(734 cm⁻¹)与果胶(1593 cm⁻¹)的重叠峰导致分类准确率下降,证实基质稀释(≥10倍)可消除食品背景干扰。
图 6 对应苹果汁中LPS检测的SERS光谱。在(A)10×和(B)5×稀释的苹果汁溶液中检测到pHEMA/LPS复合物。所有病例的LPS最终浓度为275 μg/mL。每个谱是FON基板上10个随机选定点中5次分析复制的平均值。激光功率为38毫瓦,积分时间为15秒。
机器学习分类效能对比:采用支持向量机(SVC)模型结合光谱原始强度数据,在10倍稀释苹果汁中实现100%分类准确率(Salmonella/O26/O111),显著优于主成分分析法(PCA,74%)和决策树(64%),且计算耗时仅2.1秒/样本,满足现场快速筛查需求。
图 7 pHEMA的PCA图65/LPS复形在10×AJ(A)和5×AJ(C)中。相应的机器学习模型比较,比较主成分(PC)和强度作为特征的使用情况,总结在表(B)和表(D)中。在模型训练和交叉验证中,80%的数据被使用,其余20%作为测试集。
3.总结
该研究构建的pHEMA-FON SERS传感器结合机器学习算法,展现出极高的灵敏度与广谱识别能力,能够实现对不同菌株LPS的精准多重区分。其核心优势在于利用pHEMA聚合物作为广谱亲和探针,通过氢键作用特异性捕获LPS,不仅简化了检测流程,还避免了传统抗体探针的高成本与低稳定性问题。同时,引入机器学习算法有效处理了复杂光谱数据,大幅提升了分类准确率,即便在果汁等复杂基质干扰下,通过适度稀释与算法优化仍能保持优异的检测性能,为食源性致病菌的现场即时检测提供了兼具高灵敏度、低成本与操作简便的创新解决方案
论文链接:https://doi.org/10.1021/acsami.5c08361
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