空肠弯曲菌的基因分型方法

　　尽管空肠弯曲菌是导致最常见食源性疾病的病原体，但由于其基因组高度可变，追踪感染源仍然具有挑战性。这里对常见的是三种分型方法(MLST、PFGE和mP-BIT)进行对比，以确定最有效的基因分型工具。

　　首先利用cgMLST对菌株进行分型，发现所有的菌株根据相似度可以分为4簇，以此为标准，比较常见的3种分子分型方法。发现MLST具有最高的鉴定指数，其分型准确率可以达97%，并且需要更少的时间、耗材及细菌样品。而PFGE鉴别力低(71%)，且程序复杂。mP-BIT的分辨率也比较低(71%)，但是其操作简单。

　　参考文献： Strakova N, Michova H, Shagieva E, Ovesna P, Karpiskova R, Demnerova K. Genotyping of Campylobacter jejuni and prediction tools of its antimicrobial resistance. Folia Microbiol (Praha). 2024 Feb;69(1):207-219. doi: 10.1007/s12223-023-01093-5. Epub 2023 Oct 10.