微生物对胆汁酸修饰的多样性未被充分认识

       宿主和微生物代谢对胆汁酸和相关甾体脂质的所有修饰仍未完全表征。为了解决这一知识差距，我们通过过滤12亿个公开可用的MS/MS光谱来获取胆汁酸选择性离子模式，创建了一个可重复使用的MS/MS光谱资源。成千上万的修饰分布在动物和人体以及微生物培养中。我们使用这个质谱/质谱文库来鉴定食肉动物中普遍存在的胆酰胺多胺类。它们存在于人体内，其水平随着饮食从地中海饮食到典型美式饮食的改变而改变。这项工作强调了存在比以前认识到的更多的双酸修饰，以及利用公共大规模非靶向代谢组学数据来发现代谢物的价值。以修饰为中心的胆汁酸质谱库的可用性将为未来研究胆汁酸在健康和疾病中的作用提供信息。

代表图像：

图1. 从存储库搜索中的MassQL查询和结果

MassQL查询不仅会找到胆酸，还会找到其他含有胆甾烷结构的化合物，无论它们在类固醇核心或5碳侧链上的羟基修饰或羧酸上的修饰如何。我们的库中约60%的MS/MS光谱可以使用最先进的分子式预测工具计算出原子组成。其余40%是多种修饰（例如，NH3的加入和OH的减去导致δ质量为0.984，无法用单一原子组成解释），非C、H、N、O、S和P的修饰，目前分子式预测工具尚不能很好地处理。为了验证工具预测的原子组成分配，鼓励希望使用我们的光谱库进行结构阐明的最终用户，仔细检查MS/MS光谱，可能与建议附加到胆酸上的共轭部分的MS/MS光谱（如果有的话）进行比较，在两个光谱之间匹配报告离子。如果使用得当，这种光谱资源可以为胆酸尚未发现的生物学提供前所未有的见解。

全文链接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38471500/