全基因组测序技术研究克罗诺杆菌

Ondrej Holý等研究人员使用全基因组测序（WGS）筛选从食品和奶粉生产环境中分离的阪崎克罗诺杆菌菌株中编码抗生素耐药性、适应性和毒力的基因。使用综合抗生素耐药性数据库（CARD）平台、ResFinder和PlasmidFinder工具检测毒力（VGs）和抗生素耐药性基因（ARGs）。使用圆盘扩散法进行敏感性测试。通过MALDI-TOF MS和核糖体MLST鉴定了15株Cronobacter spp.推定菌株。在脑膜炎病原体ST4中发现9株阪崎肠杆菌：2株为ST83，1株为ST1。使用基于3678个位点的核心基因组MLST进一步区分阪崎肠杆菌ST4菌株。几乎所有菌株（93%）都对头孢丁耐药，33%对氨苄青霉素耐药。此外，还检测到20个ARGs，主要涉及调节性和外排性抗生素。检测到99个VG，它们编码OmpA、铁载体和参与代谢和应激的基因。检测到IncFIB（pCTU3）质粒，流行的可移动遗传元件（MGE）为ISEsa1、ISEc52和ISEhe3。本研究中分析的阪崎肠杆菌分离株含有ARGs和VGs，这可能有助于它们在奶粉生产环境中的持久性，并增加易感人群的感染风险。

本研究中分析的阪崎肠杆菌分离株含有ARGs和VGs，这归因于它们在奶粉生产环境中的持久性，并且由于存在对抗生素的多重耐药性菌株，增加了易感人群的感染风险，降低了治疗感染的可能性，这对现有克罗诺杆菌耐药性研究具有一定的借鉴意义。

Holý, O.; Parra-Flores, J.; Bzdil, J.; Cabal-Rosel, A.; Daza-Prieto, B.; Cruz-Córdova, A.; Xicohtencatl-Cortes, J.; Rodríguez-Martínez, R.; Acuña, S.; Forsythe, S.; et al. Screening of Antibiotic and Virulence Genes from Whole Genome Sequenced Cronobactersakazakii Isolated from Food and Milk-Producing Environments. Antibiotics 2023, 12, 851.

DOI：10.3390/ antibiotics12050851