人诺如病毒(GII)在地表水中的持久性：衰减速率常数和灭活机制

  人诺如病毒( human norovirus，HuNoV )是引起急性胃肠炎的重要原因，可通过水接触传播，但其在水中的持久性尚不清楚。2023年发表在《Environmental Science & Technology》上的《Persistence of Human Norovirus (GII) in Surface Water: Decay Rate Constants and Inactivation Mechanisms》一文通过测量地表水(利用HIE系统进行病毒复制的测定)中HuNoV的感染性损失，比较其与完整HuNoV衣壳和HuNoV基因组持久性的感染性损失，并评估不同地表水条件下的灭活机制。

  在这项研究中，作者通过实验室微宇宙实验，测定了在15和20 ° C孵育的淡水溪流中悬浮在用过滤方法消毒的地表水中的HuNoV的感染性丧失，比较了感染性HuNoV与完整病毒衣壳和HuNoV基因组的持久性，并推断了感染性丧失的原因。

  图 1 通过HIE试验评估了HuNoV在15和20 ° C黑暗条件下孵育的用过滤方法消毒的地表水中随时间的持久性。

  图 2 通过实验得到k值的变化规律。

  在新鲜的、用过滤方法消毒的的San Pedro Creek地表水中，在两个孵育温度( 15、20℃;图1)下评估了感染性HuNoV ( GII.4 )、短和长的HuNoV基因组片段以及完整的HuNoV衣壳的持久性。

  实验15 - 1测得的一级衰减速率常数( k值)为2.2 day-1，大于包括实验15 - 2在内的其他实验(图2 )。值得注意的是，由于时间序列中只有两个数据点是可量化的，因此无法为这个k值提供标准误差值(图1 )。通过RT - qPCR评估了HuNoV基因组的1个短( 89 nt )和4个长( 500 nt )片段的持久性。通过HIE实验评估，与感染性HuNoV相比，短和长的基因组片段更持久地存在( k值明显变小) (图1 )。在实验15 - 1中，长基因组片段的k值与短基因组片段相似，其他所有实验和实验15 - 1 ( p > 0.05 ;图2)的区域1扩增子均未观察到明显的衰减。

  4个针对HuNoV基因组长片段的RT - qPCR实验用于通过确定每个实验的全基因组k值来量化HuNoV基因组的整体持久性。实验15 - 1 ( 1.5 ± 0.27 day- 1)的全基因组k值大于单个长链RT - qPCR实验( 0.093 ± 0.020至0.12 ± 0.016 day- 1)的k值，与HIE实验( 2.2 day- 1 ;图2)的k值相近。其余实验(全基因组k值与0无显著差异;图2和表2)未见明显衰减。

  通过比较使用全基因组外推方法、RNase 预处理(测量完整病毒衣壳内的 gRNA)和 HIE 测定获得的 k 值，可以推断出有关 HuNoV 失活机制的信息。全基因组k值和感染性HuNoV的k值之间的相似性表明，基因组损伤可能是HuNoV失活的主要机制。

  参考文献：

  [1] Kennedy LC, Costantini VP, Huynh KA, et al. Persistence of Human Norovirus (GII) in Surface Water: Decay Rate Constants and Inactivation Mechanisms. Environ Sci Technol. 2023;57(9):3671-3679.