纳米抗体PROTAC降解流感核蛋白实现跨亚型广谱保护
甲型流感病毒每年造成 300‑500 万例重症,死亡人数达 29 万‑65 万。除季节性流行的H1N1、H3N2亚型外,H5、H7、H9等禽源流感病毒不断突破物种屏障感染人类。其中H5、H7亚型累计人类感染病例超2600例,病死率超过40%。当前防控手段存在明显短板:疫苗受 HA 抗原漂移限制,毒株需要定期更新;奥司他韦、扎那米韦等传统抗病毒药物已经出现耐药毒株;即便新型药物巴洛沙韦、法匹拉韦,同样存在耐药发生的隐患。因此,研发靶向病毒保守蛋白、能够规避抗原变异干扰的广谱抗病毒手段,具有十分迫切的现实需求。蛋白降解靶向嵌合体(PROTAC)通过招募E3泛素连接酶使靶蛋白泛素化后被降解,与传统抑制剂占据活性位点的机制不同,只需结合靶蛋白即可促其降解。纳米抗体分子量小、稳定性高、组织穿透性好,适合构建PROTAC。流感病毒NP蛋白序列保守、表达丰度高(仅次于M1),是理想的广谱抗病毒靶点。
中国农业科学院哈尔滨兽医研究所团队在《Signal Transduction and Targeted Therapy》上发表论文《A nanobody-based proteolysis-targeting chimera offers broad-spectrum protection against diverse influenza virus infections》,将NP特异性纳米抗体与VHL E3连接酶α结构域融合,构建Nb-PROTAC,系统评价其体外和体内抗流感效果。具体结果如下:
1、Nb-PROTAC构建与初步筛选:
选取Schmidt等报道的5种NP纳米抗体(Nb52、Nb77、Nb135、Nb170、Nb355),分别与VHL α结构域融合,构建VHL-Nb52、VHL-Nb77、VHL-Nb135、VHL-Nb170、VHL-Nb355。在293T细胞中共转染NP-eGFP和VHL-Nb后,VHL-Nb135和VHL-Nb170组的荧光强度显著低于对应Nb组。Western blot显示,VHL-Nb135和VHL-Nb170组NP相对丰度分别降至30.0%和26.2%,而其他三种VHL-Nb组NP水平仍在71%以上。值得注意的是,Nb135和Nb170在Schmidt研究中属于弱抑制剂,但转化为PROTAC后降解能力反而最强,说明抑制活性与降解效率并不一致。
2、广谱降解能力验证
通过免疫共沉淀检测VHL-Nb135和VHL-Nb170与16种HA亚型(H1-H16)NP的结合,两者均可与全部16种NP共沉淀。降解实验显示,VHL-Nb135和VHL-Nb170对16种亚型NP均有降解作用,其中对H1、H2、H5、H6等亚型降解幅度较大(NP相对丰度降至40%-60%),对H12、H16等降解幅度较小,但均显著低于对应Nb组。对照VHL-Nb-Spike对NP无降解作用。
3、 细胞水平抗病毒效果
在A549细胞中,VHL-Nb135和VHL-Nb170均显著降低H1N1、H3N2、H5N1、H7N9、H9N2五种病毒的滴度。VHL-Nb170在24、48、72小时各时间点的病毒滴度均低于VHL-Nb135,抑制效果更强。发现表明,将纳米抗体发展成PROTACs可以显著增强其对流感病毒的抗病毒活性。
4、 小鼠体内保护效果
VHL-Nb135和VHL-Nb170在A549细胞中表现出广谱抗病毒活性,但VHL-Nb170抑制流感病毒复制的效果优于VHL-Nb135。研究采用AAV-LungM3载体经气管给药模型,每只小鼠接受两次5×10^10 vg,间隔3天,共1×10^11 vg。三周后以5 MLD50的H1N1(PR8)或H5N1(SD012)攻毒。H1N1攻毒组中,mVHL-Nb170组鼻甲病毒载量降低99.94%,肺部降低94.51%;对照组10天内全部死亡,mVHL-Nb170组体重下降不到10%,10只小鼠中9只存活(90%)。H5N1攻毒组中,mVHL-Nb170组鼻甲病毒载量降低96.71%,肺部降低93.86%;对照组14天内全部死亡,mVHL-Nb170组无明显体重下降,10只中8只存活(80%)。针对NP降解的纳米抗体PROTAC技术有效抑制流感病毒体内复制,并保护至少80%的小鼠免受不同流感病毒亚型的致命感染。
5、 降解机制解析
通过免疫沉淀进行泛素化分析,结果显示VHL-Nb170显著增强NP的泛素化修饰。MG132和LY294002分别抑制蛋白酶体和自噬溶酶体途径,蛋白分析显示MG132处理未影响NP降解,而LY294002处理则显著抑制NP降解。在ATG5敲除的293T细胞中,VHL-Nb170介导的NP降解完全消失,证实降解依赖自噬-溶酶体途径。免疫共沉淀筛选四种自噬受体(p62、OPTN、NDP52、TOLLIP),发现泛素化NP仅与OPTN特异性结合,说明VHL-Nb170介导的NP泛素化通过受体OPTN介导的自噬溶酶体途径被降解。
总结:该研究将纳米抗体转化为PROTAC,实现了对流感病毒NP蛋白的广谱降解。VHL-Nb170可降解全部16种HA亚型NP,在细胞中抑制人源和禽源流感病毒复制,在小鼠中经AAV-LungM3递送后对致死性H1N1和H5N1感染提供至少80%保护。机制上,泛素化NP经OPTN介导的自噬-溶酶体途径降解,不同于VHL介导的经典蛋白酶体途径,提示降解途径取决于靶蛋白自身特性。
文献连接: Zhuang Y, Chen L, Qin C, et al. A nanobody-based proteolysis-targeting chimera offers broad-spectrum protection against diverse influenza virus infections[J]. Signal Transduction and Targeted Therapy, 2026, 11(1): 182.10.1038/s41392-026-02666-9
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