无酶双荧光适体传感器实现艰难梭菌RNase H2灵敏检测

原创
来源:占英
2026-09-23 16:37:14
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核心提示:本研究将核酸适体识别、熵驱动催化(EDC)和催化发夹组装(CHA)结合,并利用序列工程化DNA模板银纳米簇(DNA-AgNCs)构建了一种无酶、免标记双荧光传感器。

艰难梭菌是一种能够形成芽孢的厌氧细菌,与抗生素相关腹泻和伪膜性结肠炎密切相关。其芽孢可在医疗环境及其他场所持续存在,增加了感染防控的难度。现有检测方法包括产毒培养、细胞毒性中和试验和酶免疫分析等,但部分方法操作较复杂,对检测时间和实验条件也有一定要求。寻找能够识别特定分子标志物的检测技术,因而成为相关研究的方向之一。

本研究选择艰难梭菌RNase H2作为靶标,利用核酸适体实现分子识别。研究人员将熵驱动催化(EDC)与催化发夹组装(CHA)连接,构建无需外源酶参与的核酸信号放大体系,并引入序列工程化DNA模板银纳米簇(DNA-AgNCs)作为荧光探针。银纳米簇的发光受到DNA成核序列及局部碱基环境影响,适合将核酸构象变化转化为荧光信号。研究采用红、黄两个发射通道,目标物存在时红光增强、黄光减弱,利用两种信号的比值进行分析,以减小部分环境波动对单通道检测的影响。

研究内容

图1.磁分离与EDC-CHA级联扩增的可行性验证

磁珠固定的适体结合RNase H2后释放c-Apt,启动EDC-CHA反应。PAGE显示,Apt与c-Apt形成双链(泳道3),加入目标后出现游离c-Apt(泳道4)。EDC复合物在泳道6迁移最慢,加入c-Apt后部分解离(泳道8),与燃料链共同作用后进一步解离(泳道9)。CHA仅在X1存在时形成T1-H-P组装产物(泳道7)。完整体系荧光明显增强(图1G),级联反应约30分钟达到平台,快于单独CHA(图1H)。

图2. DNA-AgNCs的结构表征与发光特性

红光AgNCs与富G序列作用后,粒径由3.69 nm增至7.58 nm(图2A、2B),黄光AgNCs则由6.54 nm减至4.82 nm(图2D、2E)。高分辨电镜观察到0.236 nm的晶格间距(图2C、2F)。XPS检出DNA模板相关元素及Ag(0)、Ag(I)(图2G、2H)。红光簇在554 nm激发下于622 nm发射,黄光簇在496 nm激发下于570 nm发射(图2I),为双通道检测提供了条件。

图3.双模式荧光响应与稳定性

CHA触发发夹构象改变,使富G序列靠近银纳米簇,红光增强、黄光减弱(图3A)。图3B、3C展示了两种探针的发光特征。在25℃下储存28天,增强型红光AgNCs荧光基本稳定,未增强黄光AgNCs的强度下降33.99%(图3D)。两种浓度下的批次重复性试验中,RSD均低于6%(图3E、3F)。图3G进一步显示了双通道的反向响应,为利用荧光比值减小部分信号波动提供了依据。

图4.双荧光适体传感器的分析性能

随着RNase H2浓度增加,红光逐渐增强,黄光则减弱(图4A、4B)。研究人员采用Gompertz函数拟合非对称比率响应,原稿记录的0.01~19.95 nmol/L区间内,拟合决定系数R²为0.997(图4C)。图4D至4F比较了不同荧光模式,其中黄光通道的线性范围记为0.01~100 nmol/L。论文报告的检测限为9.27 pg/mL,公开摘要给出的检测范围为0.01~100 ng/mL。

图5. 传感器对艰难梭菌RNase H2的特异性验证

研究人员将RNase H2与大肠埃希氏菌、枯草芽孢杆菌、宋内志贺菌、肠道沙门菌和金黄色葡萄球菌的裂解液分别进行检测。图5显示,目标蛋白产生明显的荧光响应,五种非目标细菌裂解液的信号较弱,说明该体系在所测试的对照范围内具有一定选择性。不过,单独检测不同细菌裂解液,尚不能证明传感器在真实混合菌群中具有相同的抗干扰能力。

本研究将适体识别、无酶EDC-CHA级联放大与DNA-AgNCs荧光调控结合,实现了艰难梭菌RNase H2的双通道检测。红光增强与黄光减弱的反向响应,为比率定量提供了依据。在加标河水和阴性粪便样本中,原稿报告的回收率为92.7%~108.3%,重复测定RSD为4.2%~5.1%,说明该体系在所测试的模拟基质中具有一定的定量检测能力。不过,现有结果仍以加标实验为主,缺少真实临床阳性样本及现场检测验证。该方法能否用于实际诊断,还需进一步考察复杂样本中的干扰、检测流程及结果可靠性。

原文链接:https://doi.org/10.1016/j.snb.2026.139533 

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